기본 콘텐츠로 건너뛰기

[ML] 결정트리(Decision Tree) 모델

[data analysis] Bartlett 검정

Bartlett 검정

관련된 내용

Bartlett 검정은 집단(표본)간 분산에 대해 등분산성을 검정합니다. 이 검정은 두 집단 이상의 자료형식에서도 적용할 수 있으므로 t-검정 또는 일원분산분석에 적용할 자료의 등분산성 가정을 위한 검정에 사용합니다.

이 검정은 정규분포에 부합하는 k개의 그룹에 대한 자유도 k-1인 카이자승(χ2) 분포를 기반으로 합니다. 결정기준인 검정 통계량은 식 1과 같이 계산됩니다. χ2 분포를 기반으로 하기 때문에 표본이 정규분포를 따르는 것을 전제조건으로 합니다. 만약 표본이 비정규 분포에서 추출된 표본의 경우 이 검정은 단순히 분포의 비정규성을 검정하는 것일 수 있습니다.

\begin{align}T&=\frac{(N-k)\ln(s^2_p)-\sum^k_{i=1}(N_i-1)\ln(s^2_i)}{1+\frac{1}{3(k-1)}\left(\left(\sum^k_{i=1}\frac{1}{n_i-1}\right)-\frac{1}{N-k} \right)}\\& s^2_i:\, \text{i 레벨(그룹)의 분산}\\& N: \,\text{자료의 크기} \\& k: \,\text{레벨(집단)의 수} \\& s^2_p: \,\text{합동분산(pooled variance)} \end{align} (식 1)

합동표준편차(pooled standard deviation) 참조

$$s^2_p=\sum^k_{i=1} \frac{N_i-1}{N-k}s^2_i$$ (식 2)

검정의 가설은 다음과 같습니다.

귀무가설(H0): 집단들의 분산이 같다.
대립가설(Ha): 최소한 두 집단간의 분산이 다르다.

Bartlett 검정은 scipy.stats.bartlett(smaples...) 함수를 사용할 수 있습니다. 이 함수는 통계량과 유의확률(p-value)를 반환합니다.

예 1)

랜덤수로 이루어진 세 그룹의 등분산성을 검정하기 위해 Bartlett 검정을 실시합니다.

size=(10, 3)
np.random.seed(3)
x=np.random.randint(0, 100, size=(10, 3))
print(x)
[[24  3 56]
 [72  0 21]
 [19 74 41]
 [10 21 38]
 [96 20 44]
 [93 39 14]
 [26 81 90]
 [22 66  2]
 [63 60  1]
 [51 90 69]]
st, pV=stats.bartlett(x[:,0],x[:,1],x[:,2])
print(f'통계량: {round(st, 3)}, p-value: {round(pV, 3)}')
통계량: 0.157, p-value: 0.925

위 결과는 세 그룹의 분산이 같다는 귀무가설을 기각할 수 없음을 나타냅니다.

예 2)

일정기간의 코스피지수, 코스탁지수, 다우존스지수, 원-달러 환율의 일일 종가의 변화율 자료들의 등분산성을 검정합니다.

kos kq dj WonDol
1 0.016 0.008 0.006 0.002
2 -0.007 -0.004 0.014 -0.000
3 0.021 0.008 0.007 0.000
4 0.040 -0.001 0.002 0.006
5 -0.001 -0.011 -0.003 -0.000

이 자료는 다음 코드에 의해 호출하고 계산합니다.

st=pd.Timestamp(2021,1, 1)
et=pd.Timestamp(2024, 5, 30)
code=["KS11", "KQ11", "DJI", "USD/KRW"]
nme=['kos','kq','dj','WonDol']
da=pd.DataFrame()
for i in code:
    x=fdr.DataReader(i,st, et)['Close']
    x1=x.pct_change()
    da=pd.concat([da, x1], axis=1)
da.columns=nme
da.index=range(len(da))
da1=da.dropna()
st, pV=stats.bartlett(da1['kos'], da1['kq'], da1['dj'], da1['WonDol'])
print(f'통계량: {round(st, 3)}, p-value: {round(pV, 3)}')
통계량: 586.71, p-value: 0.0

위 결과의 매우 낮은 유의확률은 귀무가설을 기각할 수 있음을 나타냅니다. 즉, 각 그룹의 분산은 동일하지 않습니다. 그러나 bartlett 검정은 정규분포에 부합되는 자료들에만 적용할 수 있습니다. 다음 결과와 같이 위 자료들은 정규성을 따르지 않으므로 위 결과는 신뢰할 수 없습니다.

st, pv=np.array([0]), np.array([0])
for i in nme:
    st1,pv1=stats.shapiro(da1[i])
    st=np.append(st, st1)
    pv=np.append(pv, pv1)
re=pd.DataFrame([st[1:], pv[1:]], index=["통계량", "p-value"], columns=nme)
np.around(re, 3)
koskqdj WonDol
통계량 0.991 0.985 0.984 0.978
p-value 0.000 0.000 0.000 0.000

위 결과로부터 모든 표본은 정규분포에 부합한다고 가정할 수 없습니다. 정규성 가정을 만족시키기 위해 각 자료들에 대한 표본분포를 구성하여 다시 검정해봅니다.

다음은 각 자료에서 300개의 표본을 추출하여 각 그룹의 평균값만으로 구성된 평균표본분포를 생성위한 코드입니다.

n=len(da1)
kos, kq, dj, wd=da1['kos'], da1['kq'], da1['dj'], da1['WonDol']
idx=[np.random.choice(range(n-1), 30, replace=False) for i in range(300)]
kos1=[kos.iloc[i].mean() for i in idx]
kq1=[kq.iloc[i].mean() for i in idx]
dj1=[dj.iloc[i].mean() for i in idx]
wd1=[wd.iloc[i].mean() for i in idx]
st_m, pv_m=np.array([0]), np.array([0])
for i, j in zip([kos1,kq1, dj1, wd1], nme):
    st_m1,pv_m1=stats.shapiro(np.array(i).reshape(-1,1))
    st_m=np.append(st_m, st_m1)
    pv_m=np.append(pv_m, pv_m1)
re=pd.DataFrame([st_m[1:], pv_m[1:]], index=["통계량", "p-value"], columns=nme)
np.around(re, 3)
kos kq dj WonDol
통계량 0.992 0.991 0.992 0.996
p-value 0.082 0.073 0.093 0.737

생성한 각 자료의 표본 분포는 모두 정규성을 만족합니다. 그러나 다음과 같이 각 자료의 분산은 동일하다고 할 수 없습니다.

st, pV=stats.bartlett(kos1, kq1, dj1, wd1)
print(f'통계량: {round(st, 3)}, p-value: {round(pV, 3)}')
통계량: 216.939, p-value: 0.0

위 표본샘플 데이터는 모두 정규분포를 따릅니다. 그러므로 각 데이터의 표준화에의해 표준정규분포에 적합시킬 수 있습니다. 즉, 표준화에 의해 4개 분포의 분산은 같아질 것입니다. 다음 코드의 결과는 이를 확인할 수 있습니다.

da2=pd.DataFrame([kos1, kq1, dj1, wd1]).T
da2.head(2).round(3)
0 1 2 3
0 0.001 0.001 -0.001 0.000
1 -0.002 -0.003 -0.000 0.002
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
scaler=StandardScaler().fit(da2)
daN=scaler.transform(da2)
print(np.around(daN[:3, :], 3))
[[ 0.466  0.429 -1.068  0.108]
 [-0.766 -1.131 -0.426  1.85 ]
 [-0.33  -1.455 -1.218 -0.165]]
st, pV=stats.bartlett(daN[:,0], daN[:,1], daN[:,2], daN[:,3])
print(f'통계량: {round(st, 3)}, p-value: {round(pV, 3)}')
통계량: 0.0, p-value: 1.0

대상 분포들이 정규분포에 부합한다는 가정이 만족되면 표준화에 의해 등분산을 가정하는 것은 합당합니다.

댓글

이 블로그의 인기 게시물

[Linear Algebra] 유사변환(Similarity transformation)

유사변환(Similarity transformation) n×n 차원의 정방 행렬 A, B 그리고 가역 행렬 P 사이에 식 1의 관계가 성립하면 행렬 A와 B는 유사행렬(similarity matrix)이 되며 행렬 A를 가역행렬 P와 B로 분해하는 것을 유사 변환(similarity transformation) 이라고 합니다. $$\tag{1} A = PBP^{-1} \Leftrightarrow P^{-1}AP = B $$ 식 2는 식 1의 양변에 B의 고유값을 고려한 것입니다. \begin{align}\tag{식 2} B - \lambda I &= P^{-1}AP – \lambda P^{-1}P\\ &= P^{-1}(AP – \lambda P)\\ &= P^{-1}(A - \lambda I)P \end{align} 식 2의 행렬식은 식 3과 같이 정리됩니다. \begin{align} &\begin{aligned}\textsf{det}(B - \lambda I ) & = \textsf{det}(P^{-1}(AP – \lambda P))\\ &= \textsf{det}(P^{-1}) \textsf{det}((A – \lambda I)) \textsf{det}(P)\\ &= \textsf{det}(P^{-1}) \textsf{det}(P) \textsf{det}((A – \lambda I))\\ &= \textsf{det}(A – \lambda I)\end{aligned}\\ &\begin{aligned}\because \; \textsf{det}(P^{-1}) \textsf{det}(P) &= \textsf{det}(P^{-1}P)\\ &= \textsf{det}(I)\end{aligned}\end{align} 유사행렬의 특성 유사행렬인 두 정방행렬 A와 B는 'A ~ B' 와 같

[matplotlib] 히스토그램(Histogram)

히스토그램(Histogram) 히스토그램은 확률분포의 그래픽적인 표현이며 막대그래프의 종류입니다. 이 그래프가 확률분포와 관계가 있으므로 통계적 요소를 나타내기 위해 많이 사용됩니다. plt.hist(X, bins=10)함수를 사용합니다. x=np.random.randn(1000) plt.hist(x, 10) plt.show() 위 그래프의 y축은 각 구간에 해당하는 갯수이다. 빈도수 대신 확률밀도를 나타내기 위해서는 위 함수의 매개변수 normed=True로 조정하여 나타낼 수 있다. 또한 매개변수 bins의 인수를 숫자로 전달할 수 있지만 리스트 객체로 지정할 수 있다. 막대그래프의 경우와 마찬가지로 각 막대의 폭은 매개변수 width에 의해 조정된다. y=np.linspace(min(x)-1, max(x)+1, 10) y array([-4.48810153, -3.54351935, -2.59893717, -1.65435499, -0.70977282, 0.23480936, 1.17939154, 2.12397372, 3.0685559 , 4.01313807]) plt.hist(x, y, normed=True) plt.show()

R 미분과 적분

내용 expression 미분 2차 미분 mosaic를 사용한 미분 적분 미분과 적분 R에서의 미분과 적분 함수는 expression()함수에 의해 생성된 표현식을 대상으로 합니다. expression expression(문자, 또는 식) 이 표현식의 평가는 eval() 함수에 의해 실행됩니다. > ex1<-expression(1+0:9) > ex1 expression(1 + 0:9) > eval(ex1) [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 > ex2<-expression(u, 2, u+0:9) > ex2 expression(u, 2, u + 0:9) > ex2[1] expression(u) > ex2[2] expression(2) > ex2[3] expression(u + 0:9) > u<-0.9 > eval(ex2[3]) [1] 0.9 1.9 2.9 3.9 4.9 5.9 6.9 7.9 8.9 9.9 미분 D(표현식, 미분 변수) 함수로 미분을 실행합니다. 이 함수의 표현식은 expression() 함수로 생성된 객체이며 미분 변수는 다음 식의 분모의 변수를 의미합니다. $$\frac{d}{d \text{변수}}\text{표현식}$$ 이 함수는 어떤 함수의 미분의 결과를 표현식으로 반환합니다. > D(expression(2*x^3), "x") 2 * (3 * x^2) > eq<-expression(log(x)) > eq expression(log(x)) > D(eq, "x") 1/x > eq2<-expression(a/(1+b*exp(-d*x))); eq2 expression(a/(1 + b * exp(-d * x))) > D(eq2, "x") a * (b * (exp(-d * x) * d))/(1 + b